Produire de nouveaux
savoirs
Explorer de nouvelles avenues pour développer la connaissance médicale de demain dans une approche qui intègre recherche fondamentale et recherche clinique.
Nos groupes de recherche sont dirigés par des chercheuses et chercheurs principaux qui collaborent dans un esprit de collégialité et de partage pour rapprocher la recherche des patients et patientes et former la relève scientifique. Ce sont des esprits libres et indépendants qui travaillent sans relâche pour améliorer la santé. Découvrez les chercheurs et chercheuses de l'IRCM.
Recherche en cours
« Nous développons des méthodes de pointe pour le profilage à haute sensibilité du protéome humain à la résolution d'une seule cellule. Plus spécifiquement, nous cherchons à comprendre le repliement et l'assemblage des complexes protéiques par la machinerie chaperonne HSP90/PAQosome et ses dérèglements dans les maladies. »
Benoit Coulombe, directeur de recherche
Protéomique translationnelle
Notre laboratoire combine l'utilisation de la spectrométrie de masse à haute performance, de l'IA et des modèles de cellules iPSC/organoïdes pour faire progresser la biologie et comprendre les maladies, en particulier la leucodystrophie, la maladie d'Alzheimer, la sclérose latérale amyotrophique (SLA) et les infections virales respiratoires à haut risque pandémique.
Nos recherches se situent en amont du développement d'un nouveau paradigme médical, appelé médecine interceptive cellulaire, qui se répand rapidement en Europe ("LifeTime Initiative") et qui vise à traiter les maladies dès les premiers signes de perturbation des réseaux d'expression génétique dans les cellules qui passent de la santé à la maladie. Pour accélérer le développement de la médecine interceptive cellulaire au Québec et au Canada, notre équipe a mis sur pied l'initiative 37TrillionCells qui regroupe plusieurs projets utilisant les technologies communes de la cellule unique et de l'omique.
Notre travail est basé sur des partenariats nationaux et internationaux avec des groupes académiques et industriels, promouvant une approche de science ouverte pour accélérer la découverte de traitements médicaux et la création de richesse pour l'économie du Québec et du Canada.
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PAIRS est un algorithme qui utilise le système d'IA AlphaFold-Multimer (DeepMind/Google) pour identifier les interactions physiques directes protéine-protéine d'origine humaine ou virale. Précédemment appelé AlphaFold-pairs, PAIRS a été développé par le laboratoire de protéomique translationnelle de l'Institut de recherches cliniques de Montréal (IRCM).
Article le plus récent
Several drugs target the PAQosome subunits
Pinard M, Moursli A, Coulombe B.
Drugs targeting the particle for arrangement of quaternary structure (PAQosome) and protein complex assembly
Expert Opin Drug Discov. 2023 Oct 15:1-15. doi: 10.1080/17460441.2023.2267974
Articles vedettes
Variants of RNA polymerase III subunits strike again and cause leukodystrophy
Macintosh J, Perrier S, Pinard M, Tran LT, Guerrero K, Prasad C, Prasad AN, Pastinen T, Thiffault I, Coulombe B, Bernard G.
Biallelic pathogenic variants in POLR3D alter tRNA transcription and cause a hypomyelinating leukodystrophy: A case report
Front Neurol. 2023 Oct 13. doi: 10.3389/fneur.2023.1254140
AI predicts protein direct physical interactions with AlphaFold-pairs
Poitras C, Lamontage F, Grandvaux N, Song H, Pinard M, Coulombe B.
High-accuracy mapping of human and viral direct physical protein-protein interactions using the novel computational system AlphaFold-pairs
bioRxiv. 2023 Aug 30:2023.08.29.555151. doi: 10.1101/2023.08.29.555151. Preprint.
A mouse model to study RNA polymerase III-related leukodystrophies
Michell-Robinson M, Watt KEN, Grouza V, Macintosh J, Pinard M, Tuznik M, Chen X, Darbelli L, Wu CL, Perrier S, Chitsaz D, Uccelli NA, Liu H, Cox TC, Müller C, Kennedy TE, Coulombe B, Rudko D, Trainor PA, Bernard G.
Hypomyelination, hypodontia and craniofacial abnormalities in a Polr3b mouse model of leukodystrophy
Brain. 2023 Aug 28:awad249. doi: 10.1093/brain/awad249
Discovery of a drug that stimulates protein complex assembly
Pinard M, Dastpeyman S, Poitras C, Bernard G, Gauthier MS, Coulombe B.
Riluzole partially restores RNA polymerase III complex assembly in cells expressing the leukodystrophy-causative variant POLR3B R103H
Mol Brain. 2022 Nov 30;15(1):98. doi: 10.1186/s13041-022-00974-z.
Discovery of a novel mode of substrate selection by the PAQosome
Pinard M, Cloutier P, Poitras C, Gauthier MS, Coulombe B.
Unphosphorylated Form of the PAQosome Core Subunit RPAP3 Binds Ribosomal Preassembly Complexes to Modulate Ribosome Biogenesis
J Proteome Res. 2022 Apr 1;21(4):1073-1082. doi: 10.1021/acs.jproteome.1c00938
Discovery of a novel neurodegenerative disorder and causative mutations
Djordjevic D, Pinard M, Gauthier MS, Smith-Hicks C, Hoffman TL, Wolf NI, Oegema R, van Binsbergen E, Baskin B, Bernard G, Fribourg S, Coulombe B, Yoon G.
De novo variants in POLR3B cause ataxia, spasticity, and demyelinating neuropathy
Am J Hum Genet. 2021 Jan 7;108(1):186-193. doi: 10.1016/j.ajhg.2020.12.002
A mechanistic model for interactome biogenesis
Coulombe B, Cloutier P, Gauthier MS.
How do our cells build their protein interactome?
Nat Commun. 2018 Jul 27;9(1):2955. doi: 10.1038/s41467-018-05448-2.
Summary of the PAQosome structure and function
Houry WA, Bertrand E, Coulombe B.
The PAQosome, an R2TP-Based Chaperone for Quaternary Structure Formation
Trends Biochem Sci. 2018 Jan;43(1):4-9. doi: 10.1016/j.tibs.2017.11.001.
Discovery of leukodystrophy-causing mutations that target assembly of RNA pol III
Thiffault I, Wolf NI, Forget D, Guerrero K, Tran LT, Choquet K, Lavallée-Adam M, Poitras C, Brais B, Yoon G, Sztriha L, Webster RI, Timmann D, van de Warrenburg BP, Seeger J, Zimmermann A, Máté A, Goizet C, Fung E, van der Knaap MS, Fribourg S, Vanderver A, Simons C, Taft RJ, Yates JR 3rd, Coulombe B, Bernard G.
Recessive mutations in POLR1C cause a leukodystrophy by impairing biogenesis of RNA polymerase III
Nat Commun. 2015 Jul 7;6:7623. doi: 10.1038/ncomms8623.
Discovery of molecular adaptors for substrate selection by the PAQosome
Cloutier P, Poitras C, Durand M, Hekmat O, Fiola-Masson É, Bouchard A, Faubert D, Chabot B, Coulombe B.
R2TP/Prefoldin-like component RUVBL1/RUVBL2 directly interacts with ZNHIT2 to regulate assembly of U5 small nuclear ribonucleoprotein
Nat Commun. 2017 May 31;8:15615. doi: 10.1038/ncomms15615.
Using machine learning to build protein interaction networks
Jeronimo C, Forget D, Bouchard A, Li Q, Chua G, Poitras C, Thérien C, Bergeron D, Bourassa S, Greenblatt J, Chabot B, Poirier GG, Hughes TR, Blanchette M, Price DH, Coulombe B.
Systematic analysis of the protein interaction network for the human transcription machinery reveals the identity of the 7SK capping enzyme
Mol Cell. 2007 Jul 20;27(2):262-274. doi: 10.1016/j.molcel.2007.06.027.
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