Microscopie et imagerie
Le plateau de microscopie et imagerie est équipé de microscopes optiques permettant de faire l’acquisition d’images ou de vidéos de divers échantillons vivants ou fixés. Plusieurs systèmes de détection permettent de faire ces acquisitions. De plus, différents logiciels sont utilisés pour traiter les images acquises et ainsi obtenir des données numériques telles que des quantités de cellules, des intensités relatives de fluorescence, des mesures de surfaces, des vitesses de déplacement, etc. Le personnel du plateau de microscopie mise sur l’obtention d’images et de vidéos uniformes dont la qualité permet leur analyse par des programmes informatiques automatiques. Finalement, le plateau de microscopie développe divers outils d’analyse personnalisés.
Instrumentation
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Microscopie confocale
Confocal SP8, Confocal LSM 700, Confocal LSM 710, Spinning disk Confocal (confocal à disque rotatif).
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Microscopie à acquisition par intervalles
Timelapse CAY, Timelapse CHA
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Microscopie par épi-fluorescence
DM6, DM6000, DM5500B, DM4000, DMRB
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Observation de tissus ou lames histologiques
Microscope droit DM4000B – Osteomeasure, microscope droit Axiophot, microscope à dissection MZ12, microscope MZ16FA
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Observation d'échantillons en pétri ou plaques multi-puits
Microscope inversé Axiovert S100TV, microscope inversé DMIRE
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Techniques ultra spécialisées
Tomographe Optique, microscope à dissection laser, imagerie à haut débit MetaXpress
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Analyses personnalisées
La station d’analyse est un ordinateur ultra performant où sont installées plusieurs logiciels d’analyse d’images, de vidéos et de fichiers de données volumétriques parfois combinées à des données également temporelles. Le logiciel Imaris de la compagnie Bitplane est installé sur cette station de traitement d’images et de vidéos 3D sur lequel est installé. Ce logiciel traite de façon particulièrement unique les fichiers de grande taille (parfois plusieurs GB) et permet l’analyse de fichiers autrement intraitables. Le responsable, Dominic Filion, détient une licence complète personnelle de programmeur de ce logiciel.